机密文件是指以文字、图表、音像和其他记录形式记载，商业秘密内容的资料，包括公文、档案、书刊、函件、图纸、报表、磁盘、光盘、胶片、幻灯片、照片、录音带等。
机密文件的日常管理
机密文件应根据信息的敏感性和重要性将企业信息划分为不同等级，设定不同的机密范围，限制信息的传播途
积极主动的防止竞争对手窃取或通过合法途径获取本企业的信息。其次，企业应明确涉密人员的范围权限和责任，严格控制商业秘密在本企业之中的传播范围，明确规定作为一项商业秘密，哪些人需要知道，哪些人不需要知道。否则人多口杂，一不留神就泄密，而且不利于责任的有效追究。第三，在库房管理中，可确立多人负责和有限职责的原则，采用分割组合方法保管存储商业秘密文件。例如，可将商业秘密的关键部分分解，限定员工只接触一部分，使每一涉密者不能拥有完整的商业秘密。库房设施要可靠，有条件的企业可以设密码门，只有文件管理人员才有密码通行证、定期更换密码；密件平时应锁入保险柜。第四，在用户利用管理中，要规定借阅范围、时间和签阅手续，管理者要跟踪密件的流动，最好借阅者就在机要室或阅文室查阅该文件，有特殊情况的也要当天借当天还。文件的复制要有规定和限制，原则上不应允许复制。商业秘密文件办完要及时归档，妥善保管，以免发生商业秘密纠纷时无法举证。
为确保敏感的公司文件的安全，对于废弃的文件，不要将它们往废物篓一扔完事，而应广泛使用文件粉碎机，将企业废弃文件彻底销毁，使文件无法复原，以免竞争对手从中分析出本企业的竞争动向。